Дувачки одсек настао је 1938. године, годину дана од оснивања средње музичке школе при Музичкој академији. Од самог оснивања заступљени су сви дувачки инструменти: флаута, обоа, кларинет, фагот, хорна, труба и тромбон. Први професори средње школе били су професори Музичке академије: флауте, војни капелник Љубомир Димитријевић и Јаков Срејовић, професори обое, Хуго Машер и Јосип Медван, кларинета, Фрањо Парлић и Бруно Брун. Оснивач класе фагота је професор Иван Туршић, настава хорне започиње заслугом Ивана Перка, а наставља је професор Душан Бусанчић. Први професор трубе био је Хенрих Елишер, а тромбона Антон Хоуф.

Шездесетих година XX века наставу флауте преузима Тахир Куленовић, класу обое Љубиша Петрушевски, кларинета Миленко Стефановић, а фагота Божидар Трумпеј. Настава хорне поверена је Стевану Веладиновићу, до повратка Душана Бусанчића 1975. године. Алојз Стрнад преузима класу трубе, а тромбона Бенедикт Жувела. Сви поменути професори оставили су неизбрисив траг на концертној сцени у земљи и иностранству и остварили сјајне педагошке резултате.

Из класа ових професора стасали су и наследници. Наставу флауте крајем седамдесетих преузима Љубомир Димитријевић, крајем осамдесетих наставу обое, Драган Лазић; почетком деведесетих настава хорне поверена је Јасни Петровић, а кларинета, Предрагу Стефановићу. У том периоду класу фагота преузима Мирко Исаески, трубе, Момир Петричевић, а тромбона, Љубинко Антонијевић. Из тог периода израстао је велики број изврсних дувача који и данас заузимају водеће позиције у свим симфонијским оркестрима у земљи и иностранству и постижу одличне педагошке резултате.

Данашњи одсек броји 130 ученика који су распоређени у 12 класа. Наставу флауте обављају Љубомир Димитријевић, Милица Јевић, Љиљана Радовић и Миомир Симоновић, кларинета Предраг Стефановић, саксофона Милан Савић, обое Бојан Пешић, а фагота Милош Николић. Настава хорне поверена је Јасни Петровић, трубе Милану Милићу, а тромбона Никола Петровић. Последњих година дувачком одсеку припојен је и одсек за удараљке који води Миона Бацковић. Сви заједно настављају светлу традицију школе постижући врхунске резултате на бројним домаћим и међународним такмичењима. Велики број допломаца овог одсека наставља школовање на домаћим и иностраним високошколским установама.